近日,中國(guó)科研團(tuán)隊(duì)在中國(guó)空間站天宮空間站首次發(fā)現(xiàn)并鑒定了一個(gè)微生物新物種,將其命名為“天宮尼爾菌”(Niallia tiangongensis),這是首次在中國(guó)空間站發(fā)現(xiàn)新物種,拓展了我們對(duì)太空環(huán)境微生物多樣性的認(rèn)知邊界,該菌株擁有適應(yīng)極端太空環(huán)境的巧妙機(jī)制,這一發(fā)現(xiàn)可能具有許多實(shí)際意義。
值得一提的是,該研究用上了我國(guó)自主研發(fā)的“生命解碼器”華大智造(688114)的DNBSEQ-T7測(cè)序平臺(tái)。研究團(tuán)隊(duì)使用華大智造DNBSEQ-T7測(cè)序儀等對(duì)空間站艙內(nèi)表面微生物的基因密碼進(jìn)行逐個(gè)破譯,并通過(guò)形態(tài)觀察、系統(tǒng)發(fā)育分析、代謝分析等多學(xué)科手段,發(fā)現(xiàn)了一種革蘭氏陽(yáng)性、好氧、產(chǎn)芽孢、桿狀菌株JL1B1071T。最終,研究團(tuán)隊(duì)確認(rèn)了這個(gè)從未被記載的新物種。
華大智造DNBSEQ-T7測(cè)序儀被業(yè)界譽(yù)為“超級(jí)生命計(jì)算機(jī)”,支持PE100和PE150測(cè)序讀長(zhǎng),支持1至4張載片靈活上機(jī)、獨(dú)立運(yùn)行,最快可在24小時(shí)內(nèi)生成至少7Tb的數(shù)據(jù),單張載片有效reads數(shù)提升到了5800M。它超強(qiáng)的日生產(chǎn)能力使其廣泛適用于全基因組測(cè)序、全外顯子組測(cè)序、多組學(xué)、醫(yī)學(xué)科研、農(nóng)業(yè)基因組學(xué)、復(fù)雜微生物群落宏基因組學(xué)等領(lǐng)域。
從航天員的精準(zhǔn)采樣,到華大智造測(cè)序儀的精準(zhǔn)解碼,再到科研團(tuán)隊(duì)的精準(zhǔn)分析,每一個(gè)環(huán)節(jié)都閃耀著中國(guó)智慧。這是一個(gè)了不起的發(fā)現(xiàn),它不僅是我國(guó)在太空探索領(lǐng)域的又一突破,更意味著人類對(duì)生命奧秘的認(rèn)知往前邁了一大步。
這項(xiàng)研究以:Niallia tiangongensis sp. nov., isolated from the China Space Station為題,發(fā)表在了International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology期刊上。
研究團(tuán)隊(duì)表示,天宮尼爾菌具有更強(qiáng)的抗氧化應(yīng)激的能力,并且能夠逆轉(zhuǎn)輻射造成的損傷。破譯其在太空環(huán)境中的生存機(jī)制,有助于為微生物設(shè)計(jì)精準(zhǔn)且有針對(duì)性的控制策略,有望在包括太空技術(shù)、農(nóng)業(yè)和醫(yī)學(xué)在內(nèi)的多個(gè)領(lǐng)域加以應(yīng)用。
這項(xiàng)研究是中國(guó)空間站居留艙微生物監(jiān)測(cè)任務(wù)(CHAMP)的一部分,該微生物樣本采集于2023年5月,當(dāng)時(shí)神舟十五號(hào)航天員乘組在空間站執(zhí)行任務(wù),他們?cè)诳臻g站度過(guò)了六個(gè)月,在此期間,他們使用無(wú)菌濕巾從空間站各艙段表面采集微生物樣本,然后將這些濕巾冷凍起來(lái)帶回地球。研究團(tuán)隊(duì)對(duì)這些樣本進(jìn)行了基因組測(cè)序和代謝分析,從中發(fā)現(xiàn)了一種革蘭氏陽(yáng)性、好氧、產(chǎn)芽孢、桿狀菌株JL1B1071T。
該菌株屬于細(xì)胞桿菌科的尼爾屬,其基因組大小為5166230個(gè)堿基對(duì),G+C含量為35.6 mol%。與其在地球上親緣關(guān)系最近的環(huán)狀尼爾菌(Niallia circulans)ATCC 4513T 菌株相比,其在基因組結(jié)構(gòu)、特征蛋白表達(dá)和代謝途徑上存在顯著差異,基因組分析顯示,兩者的基因組相似度僅為83.3%,遠(yuǎn)低于物種界定標(biāo)準(zhǔn)(95%),因此,研究團(tuán)隊(duì)認(rèn)為,它是一個(gè)全新物種,并將其命名為“天宮尼爾菌”(Niallia tiangongensis)。
天宮尼爾菌主要的細(xì)胞脂肪酸為反式異戊酸C15:0和異戊酸C15:0。主要的醌類物質(zhì)為甲萘醌-7(MK-7)。值得注意的是,天宮尼爾菌具有獨(dú)特的水解明膠的能力,這表明它能夠在營(yíng)養(yǎng)有限的環(huán)境中利用明膠作為底物。
基因組分析還顯示,天宮尼爾菌在GAF結(jié)構(gòu)域含蛋白和DNA連接酶D蛋白中存在兩個(gè)關(guān)鍵的保守特征的插入/缺失(indel)突變,這些特征序列是尼爾菌屬的特有標(biāo)志性序列。
此外,研究團(tuán)隊(duì)還發(fā)現(xiàn),天宮尼爾菌的BshB1和SplA蛋白發(fā)生顯著突變,導(dǎo)致其在結(jié)構(gòu)和功能上存在差異,這些差異可能增強(qiáng)生物膜的形成、氧化應(yīng)激反應(yīng)以及輻射損傷修復(fù)能力,從而有助于其在太空環(huán)境中的生存。
總的來(lái)說(shuō),該研究基于表型、生理生化特征以及基因組注釋,表明發(fā)現(xiàn)于中國(guó)空間站的菌株JL1B1071T是尼爾菌屬中的一個(gè)新物種,并建議命名為天宮尼爾菌(Niallia tiangongensis)新物種。